2012年11月22日，由北京大学公共卫生学院承办的中澳卫生与艾滋病项目结束大会在北京举行。来自中国卫生部、澳大利亚国际发展署、中国商务部、澳大利亚卫生与老龄事务部，及中澳卫生与艾滋病项目各执行单位的代表和项目专家，共150余人出席了会议。会议由卫生部国际合作司司长任明辉主持，中国卫生部部长陈竺与澳大利亚驻华大使孙芳安出席会议开幕式并致辞。
从2007年8月 至2012年12月期间，项目在澳大利亚国际发展署的资助下共支持开展了53个项目活动，总资金3240万澳元（约合2.1亿元人民币），这些活动是由29个中国卫生机构负责执行，同时也得到了26个澳方合作伙伴的支持与合作。北京大学公共卫生学院郭岩、吴明、孟庆跃、张拓红等多位教授学者作为专家或项目负责人参与了该项目。
项目实施期正值中国深化医改的关键时期，有力促进了卫生改革的进程，并产生了积极的政策影响。如支持中国卫生部发布《中国吸烟危害健康报告》，支持加强中国卫生体系建设，支持开展了社区卫生技术规范制定、卫生管理干部培训等活动，促进了卫生系统能力建设。此外，项目支持的活动成果先后在中国核心学术期刊上发表了170多份政策研究分析成果。中方实施机构与澳方合作伙伴合作撰写的文章在12个国际期刊上发表， 增加了国际社会对中国卫生改革与发展的认识，提高了中国在全球卫生中的地位，为将来更好的开展区域卫生及全球卫生合作做了有益的尝试。
卫生部长陈竺表示，通过该项目合作，两国卫生合作日趋深化，呈现全方位、宽领域、多层次的发展势头，进一步深化了两国卫生领域务实合作的伙伴关系，为今后双方探索新的合作打下了坚实的基础，他还就未来中澳卫生合作提出了建议。澳大利亚驻华大使孙芳安表示, 中澳卫生与艾滋病项目对于加强两国双边关系起到了重要的补充和支持作用。今后, 澳大利亚将继续开展与中国在区域和全球卫生领域的合作, 包括在亚太地区共同应对如耐药性疟疾和艾滋病等传染病的威胁。
北京大学公共卫生学院全球卫生学系主任刘培龙教授主持了专题讨论，中国卫生部、澳发署、中国商务部和澳大利亚卫生与老龄事务部代表一起就未来中澳两国合作的新领域和新方向进行了讨论，并在全球卫生、深化医药卫生体制改革领域方面的合作达成共识。北京大学中国卫生发展研究中心刘晓云副教授代表项目组做了政策影响评估报告。公共卫生学院郭岩教授、徐善东副院长、谢铮讲师等参加了大会。
